תיקונים הושלמו, ה"הובי" הפליגה לפרל הארבור ב-29 ביולי כדי להפוך לספינת הדגל של טייסת המוקשים השנייה (מפקד ו.ר. לוד). היא יצאה מפורט פרוויס באי פלורידה, באיי סולומון, ב-6 בספטמבר כחלק ממסך נגד צוללות עבור קבוצת התמיכה המערבית של האדמירל ג'סי ב. אולדנדורף למבצעים בדרום פאלאוס. לאחר סריקות בין האיים אנגאור ופליו ובמעבר קוסול, ה"הובי" החלה סיור נגד צוללות באזור ההובלה ליד אי פלליו. היא הצטרפה לקבוצת הניקוי של מוקשים והידרוגרפיה של קבוצת נושאות הליווי של האדמירל תומאס ספראג' לפלישה לליטה.
(17-25 באוקטובר 1944). ב-17 ביוני, היא החלה להתקדם לפני הספינות המהירות והספינות לתמיכה באש בגישה לחופי הנחיתה באי דינאגט. לאחר סריקות נוספות דרך מפרץ לוק והגישה לטקלובאן-דולאג, הופיעה הווי במאנוס ב-25 באוקטובר.