כותב המשך לפרק זה - האפר יצא לחופשה רפואית ב-1855 ובמלחמת אנגלו-סינית השנייה
עיכבו את חזרת האפר מחופשה עד 1859. בעקבות המלחמה, עם זאת, האמנות שנוצרו על ידי המלחמה קידמו גישה חופשית ללא הגבלות לקנטון. זה הוביל לעלייה במספר המיסיונרים בקנטון עם גידול בהפכתם לנצרות. בשנות ה-60 של המאה ה-20 ייסד האפר את הכנסייה הפרסביטריאנית הראשונה, בתי ספר יומיים ומעולים רבים, ובית ספר להכשרה לשרת מטיפים, מורים וקולפורטורים של קנטון. האפר שימש ככומר בכנסייה הפרסביטריאנית הראשונה בקנטון, שהוקמה בשנת 1862. באמצעות הקמת צורות רבות של שירותי חינוך, האפר השיג את משימתו להביא חינוך נוצרי גבוה לסין, אם כי רוב הסטודנטים של בית הספר להכשרה כללו את אלה שעבדו עבור הכנסייה. על מנת להגיע למנהיגים ממשלתיים סיניים באמצעות חינוך מערבי, בין השנים 1865 ו-1867, הופר ניהל את מכללת המתרגמים של ממשלת סין בקנטון ולימד אנגלית ומתמטיקה לתלמידים שנכנסו לשירותים ממשלתיים כמומחים זרים. על ידי הצגת תורות נוצריות בתוך הקורסים שלו, הוא המשיך במשימתו של ההטפה ומצפה בצמיחה הדרגתית של הפרסביטריאנים של קנטון. זה נתמך על ידי הסטטיסטיקה שדווחה ממיסיון קנטון שב 1866: 147 אנשים נרשמו בבתי ספר של המיסיון.