במהלך העונה, שומאכר שימש כיועץ של פרארי ו"סופר עוזר" של ז'אן טוד. שומאכר גם עזר לפרארי בתוכנית הפיתוח שלהם במסלול ח'רז. הוא התמקד בבדיקות אלקטרוניקה וצמיגים לעונת פורמולה 1 2008. במהלך 2008, שומאכר השתתף גם במרוצי אופנועים בסדרת IDM Superbike, אך הצהיר כי אין לו כוונה לקריירה תחרותית שנייה בספורט זה. בגרנד פרי הונגרי 2009
נהג פרארי, פליפה מאסה, נפצע קשה לאחר שנפגע מאגף ההשעיה במהלך האימונים. פרארי הודיעה כי הם מתכננים לגייס את שומאכר עבור הפרסים הגדולים הבאים עד שמסה יוכל לרוץ שוב. שומאכר ניסה מכונית פרארי F2007 מותאמת כדי להתכונן, שכן לא היה מסוגל לבדוק את מכונית 2009 בשל מגבלות בדיקות. פרארי פנתה לקבלת רשות מיוחדת ששומהר יבחן במכונית מ-2009, אך ויליאמס, רד בול וטורו רוסו התנגדו לבדיקה זו. בסופו של דבר, שומאכר נאלץ לבטל את חזרתו בשל חומרת פציעת הצוואר שקיבל בתאונת אופנוע מוקדם יותר השנה. מקומו של מאסה הוחלף על ידי לוקה באדואר, ומאוחר יותר על ידי ג'אנקרלו פיציקה.