לאחר אימונים והתרגילים בחוף קליפורניה, "מוסקוגי", מאוישת על ידי צוות משמר החופים של ארצות הברית, יצאה מסן פדרו, קליפורניה, ב-18 ביוני 1944, לנומיה, ניו קאלדוניה, שם היא הגיעה ב-18 ביולי 1944, לצוות סיור וסיוע מנומיה, ולאחר כיבושה, מפרץ הומבולדט, גינאה החדשה. סיור נגד צוללות ובדיקה של ספינות הפועלות סביב גינאה החדשה היו תפקידיה העיקריים עד אוקטובר 1944. ב-18 באוקטובר 1944, היא יצאה למסע, כדי לסרוק את קבוצת התגבורת השנייה, שהייתה בדרכה למדינה החדשה.
לייטה באיי הפיליפינים, הגיעו למפרץ סן פדרו ב-24 באוקטובר כדי לסרוק תחבורה וספינות אספקה תחת התקפות אוויריות יפניות רבות תוך כדי המתנה לקבוצת ספינות נחיתה ריקות כדי להקים את המעבר חזרה. כאשר השיירה שלה פרשה ב-26 באוקטובר 1944, מטוסים יפניים תקפו אותה שוב, ו"מוסקוג'י" הצטרפה להפיל מספר מטוסי אויב. מסע ליווי שני ללייט בתחילת נובמבר 1944 היה פחות מרגש.