ב-30 בינואר 1889, ברקינרידג' הועלה לגנרל חטיבה ומפקח הכללי של הצבא. הוא הועלה לגנרל-מייג'ור של המתנדבים במלחמת ספרד-אמריקה. הוא שירת על הצוות של חיל החמישי בקובה והיה מעורב במלחמות של אל קני וסן חואן היל
, שם היה לו סוס ירה מתחת לו.