"פייפר" נפרדה מהכוח השביעי היבשתי ב-20 בפברואר, והתייצבה בחו"ל הים הפיליפיני, שבו היא נשארה בחודשים האחרונים של מלחמת העולם השנייה. במהלך תקופה זו היא הפסיקה את ליווי בין-איים של שיירות ומחלקות סיור נגד צוללות רק פעם אחת, בסוף יולי, ליווי לגואם. היא חזרה ללייטה ב-10 באוגוסט, ונשארה במזרח הרחוק לאחר
במהלך החודשים הבאים סיור במים הפיליפינים, ליווי שיירות לאוקינאווה, ולפני הפליגה לארה"ב, נשא אנשי צוות לשנחאי. ב-24 בנובמבר יצאה מהחוף הסיני, ולאחר חזרה קצרה לפיליפינים, פליגה מזרחה.