מרגרט נולדה בטירת פארלי האנגרפורד בסומרסט, הבת היחידה של ג'ורג' פלאנטג'נט, הדוכס הראשון מקלארנס, ואשתו איזבל נוויל, הבת הבכורה של ריצ'רד נוויל, הרוזן ה-16 של וורוויק, ואשתו אנה דה בושאמפ, הרוזנת ה-16 של וורוויק. סבא מצד אמה נהרג בקרב נגד דודו, אדוארד הרביעי, בקרב בארנט
אני לא יודע. אביה, שכבר היה דוכס קלרנס, נוצר אז לורד סאליסברי וורוויק. אדוארד הרביעי הכריז שאחיה הצעיר של מרגרט, אדוארד, צריך להיקרא "רוזן וורוויק" ככותרת נימוס, אך לא נוצר עבורו שום מעמד. למרגרט הייתה זכות על הרוזנות וורוויק, אך הרוזנות הוחרמה על ידי אחיה אדוארד.