כתוב המשך לפרק זה - בשנת 1936, המטה הכללי של הצבא היה מאורגן מחדש. בשנת 1940-1941, במהלך המלחמה היוונית-איטלקית
במהלך תקופת השביתה הגרמנית ליוון, המטה הכללי של הצבא שימש כגרעין של המפקדה הכללית תחת מפקד המטה הכללי לשעבר, סגן גנרל אלכסנדר פאפאגוס. בעקבות הכיבוש של יוון על ידי מעצמות הציר, כוחות הצבא היווניים הוקמו מחדש במזרח התיכון על ידי הממשלה היוונית בגלות, יחד עם המטה הכללי של הצבא.