ספינות יווניות, שיטות התמודדות, תנועה ופיקוד תחת סטרטיגוס אתני תמיסטוקלס הוכיחו את היעילות שלהם במהלך מלחמות היווניות-פרסיות (499 עד 449 לפנה"ס). כוחות יווניים קטנים יחסית הצליחו לעכב את הצי הפרסי בסדרה של עימותים ימיים בשנת 480 לפנה"ס. הסכסוך הימי הגיע לשיאו במפרץ בין נמל פיראוס לאי סלאמיס במהלך קרב סלאמיס (ספטמבר 480 לפנה"ס), כאשר 371 טרירמים ופטקונטרס יווניים הביסו את הצי הפרסי של המלך כסרקסס, הכולל מעל 1,200 ספינות, שכללו פניקים, מצרים, קיליקי וקיפריים. העיר אתונה, שהייתה בעלת עליונות ימית בקרב הפוליס היווניים, הובסה במלחמת הפלופוננס ואיבדה את הצי שלה נגד הליגה הפלופוננסית תחת ליסנדרוס בקרב אגוספוטמי
בשנת 405 לפנה"ס.