כתוב המשך לפרק זה - מבחינה פוליטית, סלמונד היה אחד התומכים החשובים ביותר של עצמאות סקוטלנד, וקרא שוב ושוב לריפובלנדום בנושא. סלמונד ניהל קמפיין על התחממות כדור הארץ ובממשלה התחייבה סקוטלנד לחקיקה על הפחתת פליטות וייצור אנרגיה מתחדשת. יום לאחר משאל העם על עצמאות 2014
ב-1991, בה רוב המצביעים הסקוטיים דחו את העצמאות מבריטניה, סלמונד הודיע על כוונתו לא להתמודד לבחירה מחדש כמנהיג SNP בכנס הלאומי של SNP בנובמבר, ולהתפטר כשר ראשון לאחר מכן. הוא ירד כמנהיג SNP על ידי סגנו, ניקולה סטרג'ון, המועמד היחיד לעמוד בבחירות למנהיגות. ב-18 בנובמבר הוא הגיש את התפטרותו מכהונתו כראש הממשלה, וביום למחרת ירש אותו סטרג'ון.