למרות המיקום החשוב, הבניין לא סבל נזק גדול מהפצצות שהרסו את מדריד במהלך מלחמת האזרחים הספרדית. במהלך המצור על מדריד
, הבניין הגיע תחת אש. חורי הכדורים עדיין נראים היום על החזית הלבנה של הבניין. חורי הכדורים נגרמו על ידי פעולות צבאיות בסוף מלחמת האזרחים (בתחילת מרץ 1939), כתוצאה מרד של סיגיסמונדו קאסאדו נגד ממשלת חואן נגרין. החוקה של מועצת ההגנה הלאומית הציבה סוללת ארטילריה בפלאזה דה סיבלס. הבניין היה מעורב בקרב ב-8 וב-9 במרץ, כאשר חיילים קומוניסטים הצליחו לכבוש את פאלאסיו דה קומוניקסיונסיוס בתוך כמה שעות, בעוד חיילי קסאדו התנגדו במשרד הצי ("Ministerio de la Marina"), במשרד המלחמה ובבנק ספרד. הרבה יותר מאוחר זה יהיה לאשר את תחילתו של הרחוב גראן ויה ("הדרך הגדולה").