השלים את המשפט הבא: בקיץ שלאחר מכן, הקפטן כריסטיאנו דוני נכלל בין החשודים בביצוע שערוריית תיקון משחקים (הידועה גם בשם "Calcioscommesse"). אטלנטה ניצבה בפני עונש של שש נקודות.
ב-19 באוגוסט, דוני הושעה לשלושה וחצי שנים מכל פעילות הקשורה לכדורגל, ובכך סיים את הקריירה שלו בגיל 38. גם המגן תומאס מנפרדיני הואשם במעורבות בשערורייה וקיבל תחילה איסור של שלוש שנים, אם כי מאוחר יותר הוא זוכה. באותה עונת הקיץ, אטלנטה חתמה על חוזה עם השחקן הארגנטיני גרמן דניס, אשר הפך לאחד מהשחקנים הכי פורה של המועדון עם 56 שערים בארבע וחצי עונות. בתחילת העונה, אטלנטה השיגה 10 נקודות בארבעת המשחקים הראשונים שלה, בעוד שהחברה עבדה כדי להגן על עצמה ועל השחקנים שלה מפני ההאשמות האלה. אטלנטה השיגה 52 נקודות לפני עונש השישה נקודות, והקמה שיא מועדון חדש עבור רוב הנקודות בסריה א. זה בא בעקבות הופעות עקביות לאורך העונה (26 נקודות בכל מחצית) וההגנה הרביעית הטובה ביותר בליגה עם 43 שערים שנפלטו, בדומה לבולוניה ופיורנטינה. המועדון הבטיח את הבטיחות של סרייה א' ביום המשחקים הרביעי לפני האחרון עם ניצחון של 2-0 מול פיורנטינה, אם כי הפסיד בשלושת המשחקים האחרונים מול מילאנו, לאציו ויונובוס.