מאניוס אקוויליוס (מת בשנת 88 לפנה"ס) היה פוליטיקאי וגנרל רומי בתקופת הרפובליקה הרומית המאוחרת. הוא היה חבר ב"גנס אקוויליה" הרומי העתיק, ככל הנראה בן של מאניוס אקוויליוס, קונסול בשנת 129 לפנה"ס. אקיליוס שימש כקונסול של רומא עם גאיוס מריוס בשנת 101 לפנה"ס. לפני הקונסוליות שלו, במהלך מלחמת קמבריה, הוא שירת כמשלח תחת מאריוס בגאליה. הוא שיחק תפקיד מרכזי במהלך קרב אקווה סקסטיה.
שם הוא הפתיע את הטוטונים בכך שתקף אותם מאחור. כאשר הוא היה קונסול שדכא מרד של עבדים בסיציליה. בתחילת מלחמת מיתרידאטוס הראשונה הוא הובס ונלכד על ידי מיתרידאטוס השישי מפונטוס שהוציא אותו להורג על ידי השפכת זהב מותך לתוך גרונו.