כתוב המשך לפרק זה - בסביבות שנת 1600 כ-900 אנשים התגוררו בכפר. במהלך המאה ה -17 קונגן סבל מספר התפרצויות של מחלות ואלימות מלחמה. בין 1609 ל-1611 הייתה התפרצות מגיפה ראשונה, השנייה התרחשה ב-1627. בערך שליש מהאוכלוסייה מתו מהמחלה. יותר ממאה תושבים נהרגו על ידי כוחות השוד של הקיסר המנצח לאחר קרב נורדלינגן
בשנת 1634. מספרם של 1,000 תושבים עבר רק במחצית הראשונה של המאה ה-18.