השלים את המשפט הבא: ב-2003, שומאכר שוב התחרה עם וויליאמס לצד מונטויה. הוא לא היה מסוגל להשתתף בבדיקות החורף בינואר, לפני העונה בגלל כאבי גב חוזרים, למרות שהוא חזר מאוחר יותר בפברואר. הוא סבל מחצית ראשונה טובה של העונה: שומאכר זכה בנקודות בשבעת המירוצים הראשונים, וזכה לפודיום הראשון שלו בעונה עם מקום שני בקנדה. שומאכר חיזק את התוצאות על ידי ניצחונות רצופים בפרס הגדול של אירופה ובפרס הגדול של צרפת. הוא הצליח לסיים במקום התשיעי ב
בריטניה. בגרנד פרי של גרמניה, שומאכר פרש בסיבוב הראשון של המירוץ לאחר התנגשות עם רובנס בארריצ'לו וקימי רייקונן, שבגללה הוא קיבל עונש של 10 מקומות ברשת למירוץ הבא. ויליאמס ערערה בהצלחה על ההחלטה ושומאכר הצליח להתאים את עצמו במקום השני בפרס הגדול של הונגריה, שם סיים במקום הרביעי.