לאחר תיקונים קצרים, "קוואליאר" הצטרפה לנחיתה של החזרות בהוואי, וב-15 בספטמבר 1944, הפליגה למאנוס, וההכנות הסופיות
הנחיתה בלייטה, הצעד הראשון לשחרור הפיליפינים. עם כוח ההתקפה הדרומי היא הפליגה ב-14 באוקטובר, ולאחר מעבר שקט, הגיעה לדולאג, לייטה ב-20 באוקטובר. תכנון והכשרה יסודיים השתלמו. הסירות של "קוואליאר" נחתו חיילים וציוד בצורה חלקה. היא נשארה מחוץ לחוף, סיימה את הפריקה וקיבלה נפגעים, עד 23 באוקטובר, כאשר היא פנתה למאנוס ערב קרב מפרץ לייטה.