ב-2013, ה-AFP הצליח לעכב את ההתקפות של חזית השחרור הלאומית המורו במשבר העיר זמבונגה כשהם פותחים מתקפה להכריז על עצמאותה של Bangsamoro Republik. ב-2016, AFP התנגש עם קבוצת Maute על Butig בפברואר בנובמבר 2016. ב-2017, ה-AFP גם התנגש עם מחבלים של דאעש במרווי.
, קורא לנשיא דוטרטה להכריז על חוק צבאי תחת הכרזה מס'216.