כתוב המשך לפרק זה - לאחר שחזר לפולין בשנת 1784, קוסצ'יוסקו הועמד למייג'ור-גנרל בצבא הקומנונוולת הפולני-ליטאני בשנת 1789. לאחר מלחמת פולין-רוסיה של 1792
הוא פיקד על התקוממות נגד האימפריה הרוסית במרץ 1794 עד שנתפס בקרב מאצ'יאוביץ' באוקטובר 1794. תבוסת מרד קוסצ'יוסקו בנובמבר הובילה לחלוקה השלישית של פולין בשנת 1795, שהסיים את הקומנוולטה. בשנת 1796, לאחר מותה של הצ'ריצה קתרינה השנייה, קוסצ'יוסקו קיבל חנינה על ידי יורשתה, הצ'אר פאולוס הראשון, והוא היגר לארצות הברית. ידיד קרוב של תומאס ג'פרסון, שאיתו שיתף את האידיאלים של זכויות האדם, קוסצ'יוסקו כתב צוואה בשנת 1798, והקדיש את נכסיו בארה"ב לחינוך ולחופש העבדים בארה"ב. קוסצ'יוסקו שב לבסוף לאירופה וחי בשווייץ עד מותו בשנת 1817. ההוצאה לפועל של צוואתו הוכיחה מאוחר יותר קשה, והכספים מעולם לא שימשו למטרה כוונתו של קוסצ'יוסקו.