כתוב המשך לפרק זה - מנקודת המבט הסובייטית מלחמת האבות הגדולה החלה ביוני 1941. בניגוד להסכם הלא תוקפנות הקיימת, הצבא הגרמני פלש לברית המועצות. ביולי 1941 קארל לינקה ובנו היינץ התנדבו להצטרף לצבא האדום, שם אחד התפקידים של לינקה היה כמפקד במחלקה פרטיזנית, תפקיד שבמשך שנתיים שילב עם זה של "מזכיר המפלגה" (הקומוניסטי) בקבוצת הפרטיזנים. בתפקיד זה הוא השתתף בפעולות צנחנים מאחורי הקווים הגרמניים באזור גומל. במהלך 1944 כמנהיג קבוצת סיור השתתף בפעולות פרטיזניות מזוינות בסלובקיה ולאחר מכן במרד הלאומי הסלובקי נגד ממשלת הציר, שהתפרץ בין אוגוסט לאוקטובר 1944. המלחמה.
נגמר בתחילת הקיץ של 1945 וקארל לינקה חזר למוסקבה, סובל מפצעים שסבל במלחמה ובגלל מותו של בנו היינץ שנהרג בזמן שנלחם עם הפרטיזנים הסלובקים.