הממלכה הספרדית כבשה את האזור במאה ה-16 והקימה ממלכה המשנה שכללה את רוב שטחיה בדרום אמריקה, עם בירת לימה. החינוך הגבוה החל באמריקה עם הקמתו הרשמית של האוניברסיטה הלאומית של סן מרקוס בלימה בשנת 1551. פרו הכריזה באופן רשמי על עצמאותה בשנת 1821, ולאחר מסעות הצבא הזרים של חוזה דה סן מרטין וסימון בוליבר, וקרב אייאקוצ'ו המכריע, פרו השלימה את עצמאותה בשנת 1824. בשנים שלאחר מכן, המדינה נהנתה יציבות כלכלית ופוליטית יחסית, שהסתיימה זמן קצר לפני מלחמת האוקיינוס השקט (1879-1884) עם צ'ילה. לאורך המאה ה־20 סבלה פרו מחלוקות טריטוריאליות מזוינות, הפיכות, מהומות חברתיות וסכסוכים פנימיים
, כמו גם תקופות של יציבות והתקדמות כלכלית. בשנות ה-90, המדינה יישמה מודל כלכלי ניאו-ליברלי שעדיין בשימוש עד היום. מאז, פרו חוותה צמיחה כלכלית מתמדת וירידה בחוסר השוויון.