בסוף המאה ה-13, פלסטין וסוריה הפכו לחזית העיקרית נגד האימפריה המונגולית המתרחבת במהירות, שהצבא שלה הגיע לפלסטין בפעם הראשונה בשנת 1260, החל עם הפשיטות המונגוליות לפלסטין תחת הכללי הנוצרי הנסטורי קיתבוקה. המנהיג המונגולי ח'ולאגו חאן שלח הודעה ללואי התשיעי של צרפת כי ירושלים הועברה למשיחיים תחת הברית הצרפתית-מונגולית; עם זאת, זמן קצר לאחר מכן הוא נאלץ לחזור למונגוליה בעקבות מותו של מונגקה, משאיר את קיטבוקה וצבא קטן. קיטבוקה נלחם עם הממלוכים תחת פיקודו של בייברס בקרב עין ג'לוט.
בעמק ישראל. הניצחון המכריע של הממלוכים בפלסטין נחשב לאחד הקרבות המשמעותיים ביותר בהיסטוריה העולמית, והקמת סימן מים גבוה עבור הכיבושים המונגולים. עם זאת, המונגולים הצליחו לבצע כמה פשיטות קצרות נוספות בשנת 1300 תחת גזאן ומולאי, שהגיעו עד עזה. ירושלים הייתה בידי המונגולים במשך ארבעה חודשים (ראה מסע הצלב התשיעי).