בשנת 1559, הקיסר פרדיננד הראשון הקים את הסוכנות של קנצלריה קיסרית ("Reichshofkanzlei") בארמון הופבורג בווינה, בראשות סגן קנצלר תחת הסמכות הנומלית של הארכיבישוף ממיינץ. בקרב ההר הלבן ב-1620
ב-1809, הקיסר פרדיננד השני יצר את משרד קנצלר בית המשפט האוסטרי האחראי על ענייני הפנים והחיצוניים של המונרכיה ההבסבורגית. החל משנת 1753, תפקיד קנצלר המדינה האוסטרית היה בידי הנסיך קוניץ. הקנצלריה הקיסרית איבדה את חשיבותה, ומאז ימיה של מריה תרזה ויוסף השני, הייתה קיימת רק על הנייר. לאחר פירוק האימפריה הרומית הקדושה, הכהן הנסיך מטרניך כקנצלר המדינה של האימפריה האוסטרית (1821-1848), כמו כן הכהן הנסיך הרדנברג כקנצלר פרוסיה (1810-1822). הקונפדרציה הגרמנית של 1815-1866 לא הייתה ממשלה או פרלמנט, רק בונדסטאג כגוף מייצג של המדינות.