היא חזרה לנורפולק לתיקונים ב-1 בינואר 1847, ואז הגיעה לוורה קרוז ב-21 במרץ 1847, נושאת את פרי כדי לקחת פיקוד על הצי האמריקאי. מיד היא ואנשיה צללו למבצעים אמפיביים נגד ורה-קרוז.
, אספקת תותחים ואנשי הצוות שלהם לקחת על החוף עבור הסוללה אשר נלחם העיר להיכנע בתוך ארבעה ימים. במהלך שאר המלחמה תרמה "מיסיסיפי" תותחים, אנשים וסירות לסדרה של פשיטות על החוף המזרחי של מקסיקו, והשתתפה בכיבוש טבאסקו ביוני 1847.