כותב המשך לפרק זה - כאשר יוון נכנסה למלחמת העולם השנייה לאחר הפלישה האיטלקית
בשנת 1940, בית הספר נסגר והקמפוס שימש בית חולים צבאי. כאשר גרמניה פלשה ליוון, הקמפוס נלקח על ידי הגרמנים כמטה כללי עבור הבלקן. מסמכי הכניעה של יוון נחתמו בבניין הראשי של בית הספר, אולם מקדוניה. בשנת 1944-45 הוקם הקמפוס על ידי הצבא הבריטי (היחידות האחרונות לא עזבו עד 1949).