ב-1917 בית המכס האמריקני הועבר לשימוש כבית משפט פדרלי ובית משפט נוצר בקומה השנייה. בית המכס האמריקני שרד את מלחמת האזרחים ומגורמים שונים, כולל שריפת גלוסטון ב-1885, הוריקן גלוסטון הגדול של 1900
, הוריקן קרלה בשנת 1967, ופיצוץ דוד בשנת 1978 שגרם לסגירת הקומה השנייה במשך כמעט שני עשורים. אף על פי שאירועים אלה דרשו תיקונים ושיפוצים נרחבים, הבנייה החסינת האש של בית המכס האמריקאי הבטיחה את ההישרדות של האלמנטים הסגוניים המשמעותיים ביותר שלו.