לי השתתף במערכה של חצי האי ב-1862, במיוחד במהלך קרב שבעת האורנים ב-31 במאי וב-1 ביוני, הקרב על תחנת סאבאג'
ב-29 ביוני, במהלך קרבות שבעת הימים מ-25 ביוני עד 1 ביולי, ובקרב גבעת מאלברן גם ב-1 ביולי. הוא שירת זמן קצר בחטיבת הפרשים הרביעית של וירג'יניה ביולי, וקידמו אותו לקולונל ב-9 ביולי, וקיבל פיקוד על גדוד ארטילריה של חיל הרס"ן ג'יימס לונגסטריט באותו חודש. תחת לונגסטריט, לי נלחם בקרב השני של מנאסאס באוגוסט, ולאחר מכן בקרב אנטיטאם ב-17 בספטמבר, שם אקדחיו שיחקו תפקיד בולט בהגנה על הקרקע ליד כנסיית דאנקר המפורסמת. להלן סיכום של מעורבותו של לי בשארפסבורג: