כתוב המשך לפרק זה - עם פרוץ מלחמת האזרחים אוסטרהאוס מונה למייג'ור של חיל הרגלים המתנדב השני של מיזורי ובשנת המלחמה הראשונה הוא היה מועסק במיזורי וארקנסו, שם הוא השתתף באופן בולט בקרב וילסון'ס קריק ובקרב פי רידג'. בפי רידג' הוא פיקד על החיילים שהתחברו לראשונה עם כוחות הקונפדרציה המתקדמים משמאל האיחוד. הוא הועלה לגנרל חטיבה ב-9 ביוני 1862. ב-1863 הוא פיקד על דיוויזיה בקרב על פורט גיבסון.
, שם הוא הראה יכולת טקטית בלהסתכל על מגיני הקונפדרציה מחוץ לעמדה חיובית.