השלים את המשפט הבא: סקופיה החלה להתאושש מעשרות שנות ירידה לאחר 1850. באותה תקופה, העיר חוותה צמיחה דמוגרפית איטית אך יציבה, בעיקר בשל היציאה הכפרית של הסלאבים המקדונים. הוא גם הוחזק על ידי היציאה של מוסלמים מסרביה ובבולגריה, אשר זכו באוטונומיה ועצמאות מהאימפריה באותה עת. במהלך רפורמות טנזימט, עלתה הלאומיות באימפריה ובשנת 1870 הוקמה כנסייה בולגרית חדשה ויצרה דיוקסיה נפרדת, המבוססת על זהות אתנית, ולא על עקרונות דתיים. האוכלוסייה הסלאבית של הבישופיה של סקופיה הצביעה בשנת 1874 ברוב מוחץ, ב-91% בעד הצטרפותה ל-Exarchate והפכה לחלק מ-Bulgarian Millet. הצמיחה הכלכלית הותרה על ידי בניית מסילת הרכבת סקופיה-סלוניקה בשנת 1873. תחנת הרכבת נבנתה מדרום לווארדאר וזה תרם להעברת פעילויות כלכליות בצד זה של הנהר, אשר מעולם לא היה אורבניזציה לפני. בגלל היציאה הכפרית, חלקם של הנוצרים באוכלוסיית העיר עלה. חלק מהחדשים הפכו לחלק מהאליטה המקומית ועזרו להפיץ רעיונות לאומניים. סקופיה הייתה אחד מחמשת המרכזים העיקריים של הארגון המהפכני המקדוני הפנימי כאשר הוא ארגן את 1903
התקוממות אילינדינית. הרשת המהפכנית שלה באזור סקופיה לא הייתה מפותחת היטב וחוסר הנשק היה בעיה רצינית. עם פרוץ ההתקוממות, כוחות המורדים גרמו לרכבת צבאית לצאת מהפסים. ב-3 וב-5 באוגוסט בהתאמה, הם תקפו יחידה עות'מאנית ששמרה על הגשר על נהר ורדר ונתנו קרב במנזר "סנט ג'ואן". בימים הבאים הלהקה נרדפה על ידי מספר רב של Bashibozuks ועברה לבולגריה.