השלים את המשפט הבא: בנוסף לעבודה הרפואית שלו, הוא הפך ליועץ ולמתורגמן של פקידים אמריקאים ומאוחר יותר היה סגן קונסול בצ'פו (ינטאי כיום) ושנחאי. מקארטי פעל במקומו של קונסול אמריקאי עד שהוקם שירות קונסולרי קבוע בשנת 1857. בתפקיד זה, במאי 1861, לבקשת קצין הדגל של ארצות הברית, סטריבלינג, הוא נכנס לנאנקינג, מעבר לקווי הקרב ועזר לשכנע את "המלך השמימי", הונג שיוקואן,
טאיפינגים להבטיח "לא הטרדה לא רק לאמריקאים ונוצרים, אלא לכל הסינים שעובדים אצלם". מאמץ זה הציל מספר גדול של נוצרים ילידים וחבריהם כאשר צבא טייפינג נכנס נינגבו.