ב-1652-1689, במהלך הסכסוכים על הגבול הסיני-רוסי, שושלת צ'ינג התעסקה ודחפה בחזרה כ-2,000 קוזקים רוסים בסדרה של עימותים מתפרקים. הגבול בדרום-מערב התרחב לאט, בשנת 1701 צ'ינג ניצח את הטיבטים בקרב דארטסדו. ח'אנת ג'ונגאר כבשה את האויגורים בכיבוש ג'ונגאר של אלטישאהר ושתלטה על טיבט. חיילי צבא הדגל הירוק של האן הסיני ונושאי דגלים מנצ'ים הונחו על ידי הגנרל היו זונג-צ'י של האן הסיני במסע הסיני לטיבט (1720)
שגרש את הג'ונגרים מטיבט והציב אותו תחת שלטון צ'ינג. במספר מקומות כמו לאסה, באטאנג, דארצ'נדו, לארי, צ'אמדו וליטאנג, חיילי הדגל הירוק היו מחוזקים לאורך כל מלחמת הג'ונגרים.