כתוב המשך לפרק זה - בשלטון, ה- YSP הותקף על ידי חילוקי דעות פנימיים. ב-1980 מוחלף איסמעיל כנשיא דרום תימן על ידי עלי נאסר מוחמד, שהיה מנהיג מתון יותר ויציבה יותר בהשוואה לשמאלנות הפרו-סובייטית של איסמעיל. הוא ביקש לשפר את היחסים עם השכנים הערבים של דרום תימן והמערב. הסכסוך בין שתי הפלגים הוביל למלחמת האזרחים בדרום תימן.
ב-1986 הובילה למותו של עבדול פתח איסמעיל, אם כי בן בריתו עלי סאלם אל ביח' השתלט על המפלגה, בעוד שהמרני יותר, היידר אבו באקר אל-אטאס, הפך לנשיא. אל-באיד ואל-אטאס תפסו תפקידים בממשלת תימן המאוחדת עד למלחמת האזרחים של 1994. בחירות פרלמנטריות נערכו באוקטובר 1986, ולמרות ש- YSP נשארה המפלגה החוקית היחידה, מועמדים עצמאיים הורשו להתמודד בבחירות, וזכו ב-40 מתוך 111 המושבים, כאשר YSP זכה ב-71 הנותרים.