בעונת 2011-12 שיחק ג'וליו סזאר את משחקו ה-200 בסרייה א' ב-1 באוקטובר 2011 בהפסד 3-0 מול נאפולי, והציל בעיטת עונש במחצית הראשונה. מאוחר יותר ב-22 בנובמבר, יוליו סזאר הופיע בפעם ה-50 בליגת האלופות של אירופה במשחק 1<unk>1 נגד טרבזונספר במשחק יום 4 של קבוצת B של ליגת האלופות של אירופה 2011/12. תיקו זה הספיק לאינטר כדי להבטיח מקום בסיבוב השמיני. ב-18 במרץ 2012 הוא השיג מאה ניצחונות ללא שער בסרייה א' כששיחק בהגרלה ללא שער נגד אטלנטה ביום המשחק 28. זה גרם לאינטר לנצח רק במשחק אחד מתוך תשעת המשחקים האחרונים. הופעתו ה-300 של חוליו סזאר בכל התחרויות עבור אינטר התרחשה ב -6 במאי בשבוע האחרון של סריה א נגד מילאן, שבה אינטר ניצחה 4-2. הוא הודה בעונש שנוי במחלוקת לקווין-פרינס בואטנג והשתתף בעימות מילולי עם זלאטן איברחמיוביץ' שהמשיך להמיר את העונש. הוא הוזכר בעונש שגרם לו לפספס את המשחק האחרון של העונה נגד לאציו. הוא סיים את העונה השביעית שלו באינטר על ידי צבירת 40 הופעות בכל התחרויות כאשר אינטר סיים במקום השישי בליגה.
, עם הקבוצה רק חמישה שערים פחות משווה את הנחה הגרועה ביותר שלהם בכל הזמנים בקמפיין אחד בסריה א. בליגת האלופות, הקבוצה הודחתה בסיבוב השש-עשרה על ידי מרסיי על פי חוק השערים הרחוקים והודחתה מקופה איטליה על ידי נאפולי. לאחר שחלק מהמתנגדים האמינו כי ג'וליו סזאר ירד בכושרו מאז עונת 2009/10, אינטר חתם על השוער הסלובני סמיר הנדנוביץ' מאודינזה כדי לקחת את מקומו כשומר ראשון.