-ההכרזה על המלחמה ב-3 בספטמבר 1939, "בבזיירס" נשלחו לפטרול בנמלים בחוף הצפוני של ספרד, שם חלק מהצי המסחרי הגרמני מצא מקלט, והיו חשודים באספקת צוללות גרמניות. בתחילת אוקטובר, הסירה נשלחה עם הדיוויזיה השמינית לאנטיל. הצוללת ליוותה שתי שיירות מליפקס, נובה סקוטיה לליברפול, וחזרה לברסט ב-20 באפריל 1940. לאחר כמה תיקונים ושיפוצים, ה"בבזיארס" נשלחו לקזבלנקה, והיה שם כאשר הפסקת הנשק בין צרפת לגרמניה
הושלמה ב-20 ביוני 1940. הצוללת סיור לאחר מכן במפרץ גינאה וחזרה לדקר ב-21 באוגוסט 1940.