השלים את המשפט הבא: שומאכר המשיך בטויוטה והיה שוב שותף של טרולי לשנת 2006. הוא היה שאפתני לעונה הקרובה: אומר, "אנחנו מחפשים לנצח כמה מירוצים. זה מה שהמטרה שלנו צריכה להיות, ובואו נקווה שהיא מציאותית". הוא התחיל את העונה בלי נקודות.
בהריין כשתי מכוניות טויוטה היו מחוץ לקצב, אבל הצליח להרוויח את נקודותיו הראשונות של הטויוטה והראשונות של העונה עם מקום שמונה במלזיה. הוא הצליח להבטיח לעצמו ולטויוטה את הפודיום היחיד של העונה באוסטרליה.