ב-1943, במהלך מלחמת העולם השנייה, הרכבת התחתית נפגעה קשה במהלך "מבצע גומורה", הפצצת ה-RAF של המבורג.
בקיץ ההוא. החלק מ "Hauptbahnhof" ל "Rothenburgsort" לא תוקן כי המחוז שעבר דרכו נהרס לחלוטין. עברו עוד חמש שנים לפני שהרשת שנותרה הייתה שוב שלמה לחלוטין.