מנהיגים מוסלמים בבונוס איירס קיבלו בברכה את החדשות על בחירתו של ברגוליו לאפיפיור, וציינו כי הוא "תמיד הראה את עצמו כחבר של הקהילה האסלאמית", ואדם שמעמדו הוא "בעד דיאלוג". הם שיבחו את הקשרים הדוקים של ברגוליו עם קבוצות מוסלמיות וזכרו את דבריו כאשר נאומו של האפיפיור בנדיקט ב-2006 ברגנסבורג
הוא היה מפורש על ידי רבים כמינוי של האסלאם. לדבריהם, ברגוליו מיד הרחיק את עצמו מהשפה של בנדיקטוס ואמר כי הצהרות שגרמו לזעם עם המוסלמים "יעזרו להרוס ב-20 שניות את הבנייה זהירה של מערכת יחסים עם האסלאם שהאפיפיור יוחנן פאולוס השני בנה במשך 20 השנים האחרונות".