בית החולים הוקם כבית החולים המלכותי לחיילי ים בגריניץ' על פי הוראותיה של המלכה מרי השנייה, אשר קיבלה השראה ממראה של מלחים פצועים שחזרו ממלחמת לה הוגה
בשנת 1692. היא הזמינה את אגף המלך צ'ארלס של הארמון - שתוכנן במקור על ידי האדריכל ג'ון ווב למלך צ'ארלס השני בשנת 1664 - כדי להיות מתוכנן מחדש כבית חולים ימי כדי לספק עמית לבית החולים של צ'לסי לחיילים. סר כריסטופר רן ועוזרו ניקולס הוקסמור נתנו את שירותיהם בחינם כאדריכלים של בית החולים המלכותי החדש. סר ג'ון ואנברו ירש את רן כאדריכל, והשלם את המתחם לפי התוכניות המקוריות של רן.