ב-1989 הוא נהג בוויליאמס FW12C החדשה עם V10 רנו. הוא התחיל עם בוטסן על הרגל האחורית בגלל תאונת בדיקות חזקה לפני העונה בריו ובגלל שחברו לקבוצה הוותיק ריקארדו פטרז היה חידוש גדול בצורת. עם זאת, בגרנד פרי הקנדי, בוטסן נהג היטב בתנאים רטובים ולקח את ניצחונו הראשון לאחר שסנה סבל מכשלת מנוע מאוחרת. למרות שזה היה ניצחון מבורך (בוטסן הפך לזוכה החדש הראשון בF1 מאז חברו לקבוצה לשעבר חצים גררד ברגר זכה
גראנד פרי מקסיקני 1986 עבור בנטון. עד אז רק סנה, פרוסט, נייג'ל מאנסל, נלסון פיקט וברגר ניצחו במירוץ), זה נחשב ניצחון בר מזל עבור הבלגי, שכן הוא היה האחרון בשלב אחד והיה לו סיבוב של 360 מעלות, אם כי למרבה המזל הוא הצליח לשמור על מכוניתו מהקירות. הוא הצליח לתפוס ולהעביר את פטרז' שהיה סובל ממתחתון רופף ולקח את המנהיגות שלושה סיבובים מהסוף כאשר מנוע הונדה V10 של סנה נלקח. עוד שלוש נקודות על הפודיום הגיעו לפני שבוטסן סיים את השנה עם ניצחון שני בגראנד פרי של אוסטרליה. למרבה האירוניה, בוטסן היה אחד הנהגים שהפגינו על התנאים במסלול לפני המירוץ.