שוב בעזרתו של ז'ו רונג'י, וואנג שימש כמזכיר הכללי של מועצת המדינה ממרץ 1998 עד מרץ 2003, בתקופה זו הוא מונה לנשיא בית הספר הלאומי למנהל (כיום "אקדמיה לניהול"), עזר לשפץ את ניהול מדיניות הילד האחד, שימש כראש הקבוצה המובילה שהפקדה על האוכלוסייה הלאומית החמישית של סין, ושב כחבר בוועדת ההנהלה שהפקדה על פסגות APEC של 2001 סביב סין. בשנת 1999, הוא גם השתתף בהעברת
של מקאו מהשלטון הפורטוגזי לשלטון הסיני. מ-5 במרץ 2003 עד 5 במרץ 2008 הוא היה סגן יו"ר הוועידה המייעצת הפוליטית העממית. בשנת 2005, הוא הוביל משלחת דיפלומטית סינית בגאנה מ-31 במאי עד 2 ביוני. הוא שימש כנשיא האגודה הבינלאומית של מועצות כלכליות וחברתיות ומוסדות דומים בין השנים 2005-2007.