כתוב המשך לקטע זה - בימיו הראשונים של האסלאם, על פי מקורות איסלאמיים, שבט יהודי של ערב (ראה בני קוראיזה) הואשם כי הפר את הסכם השלום עם המוסלמים הראשונים, וכתוצאה מכך הוצאו להורג מעל 700 יהודים. רבים מהנשים ששרדו נלקחו לאחר מכן על ידי חיילים מוסלמים; אחת מהן, ספייה בת הויה שבעלה קננה בן אל-רבי נהרג גם כן, נלקחה על ידי מוחמד כאישתו. היו רדיפות בולטות של יהודים כמו טבח פז ב-1033, טבח גרנדה ב-1066 ושוד סאפעד ב-1834. בסוף המאה ה-19, התנועה הציונית ביקשה להקים מחדש מולדת יהודית בישראל ההיסטורית, בתוך שטח פלסטין ההיסטורי, הידוע גם בשם ציון, הידוע גם בשם ארץ הקודש. הדבר יצר מתחים בין היהודים הפלסטינים לערבים הפלסטינים, שהובילו, החל משנת 1947, למלחמת אזרחים והיציאה שלאחר מכן של ערבים פלסטינים רבים ויהודים רבים ממדינות מוסלמיות. בשנת 1948, מדינת ישראל הוכרזה, ולאחר זמן קצר ההכרזה על עצמאותה, מדינות ערב הכריזו מלחמה
על ישראל, ועם ישראל הם ניצחו. לאחר מלחמת ערב-ישראל ב-1948, עוד 12 מלחמות נלחמו בין המדינות הערביות לישראל. הסכסוך הערבי-ישראלי החליש את היחסים האסלאמיים-יהודיים באופן חמור.