כתוב המשך לפרק זה - בתחילת אפריל 1945, כמה שבועות לפני סיום המלחמה
, ונאבק עם מחסור נואש של עבודה מיומנת הודות לטבח של המלחמה, הרשויות הצבאיות גויסו איוואן קץ מחוץ למחנה הריכוז לעבוד כרופא צבאי ליחידות בעיר. זה לא ברור אם הוא אי פעם רכש כל ניסיון רפואי מעשי עד לנקודה זו, אבל רפואה היה אחד הנושאים שהוא למד באוניברסיטה שלושה וחצי עשורים קודם לכן. ב-20 באפריל 1945 הוא הועבר לתפקיד רופא ראשי ליחידות הגרמניות שהוצבו במאוטהאוזן. המקורות מכבדים את תפקידו בלהבטיח שכאשר חיילי ארה"ב הגיעו בתחילת מאי 1945 המבצר של מאוטהאוזן הועבר ללא ירייה אחת שנורתה משני הצדדים. קץ נשאר בתור רופא בין ה-6 במאי ל-7 ביוני 1945, מטפל בחבריו הניצולים ממחנה הריכוז העצום, שעכשיו לא היה מועסק על ידי הצבא הגרמני אלא על ידי צבא הכיבוש האמריקאי.