גוארנירי החל את קריירת הנעורים שלו בקודוג'נה, ועשה את הופעת הבכורה המקצועית שלו בקומו בשנת 1957, גם שיחק עבור אינטרנציונל, בולוניה, נאפולי, וסיים את הקריירה שלו עם קרמונזה 1973. הוא שיחק בעיקר עבור קבוצת האינטר מילאנו הידועה בשם "לה גרנדה אינטר" תחת המנהל הלניאו הררה, בין 1958 ל-1967, וחזר בקצרה למועדון כדי להופיע 3 פעמים במהלך עונת 1969-1970. הוא היה חלק מהניצחונות של האינטר בגביע אירופה ב-1964 וב-1965, כמו כן זכה בשלושה כותרות בסריה א, שני גביעי אינטרקונטיננטל ב-1964.
ובשנת 1965. למרות שלא הצליח לזכות בקופה איטליה במהלך הקריירה שלו, הוא הגיע לגמר בעונת 1964-65, ובקושי פספס את הטרבל עם אינטר.