השלים את המשפט הבא: אקלייטס נולד בקרבת מריג'מפולה למשפחת איכרים. אביו השתתף במרד 1831 ונשלח לגלות לסיביר, שם מת. סבא החורג של אקלאיטיס נלחם בקרב מאצ'יאוביצ'ה במהלך מרד קוסצ'יוסקו, בעוד שאחיו של סבו שירת בלגיונות הפולנים באיטליה ונלחם במלחמת העולם השנייה.
קרב סומוזירה בספרד במהלך מלחמות נפוליאון. אקלאיטיס היתום גדל עם סבא וסבתא שלו וסיפורים על הקמפיינים האלה. אמו קיבלה עבודה כמשרתת במריג'מפולה, שם לקח אקלייטס שיעורים פרטיים עם כומר מקומי ואורגניסט בססנאבה. לאחר מכן הוא נרשם לבית ספר יסודי במריאמפולה, אשר סיים בגיל 17. הוא המשיך את לימודיו בבית הספר התיכון בן ארבע השנים במריאמפולה, שם הוא היה ממוקם ללא הרף כאחד התלמידים הטובים ביותר, אך עזב בלי לסיים את לימודיו בסביבות 1850. הוא המשיך ללמוד בכוחות עצמו כמה שפות. בנוסף לשפה הליטאית המולדת שלו, הוא למד פולנית, רוסית, גרמנית, צרפתית, לטינית, קצת יוונית, סנסקריט ועברית.