הוא נלחם עם היחידה בפורט הנרי, פורט דונלסון, קורינתוס, שילו, והאטצ'ר'ס ראן. לאחר מכן הוא חלה בקדחת טיפוס ונשלח ב-1 באוגוסט 1862. הוא חזר לאחר התאוששות עם ארטילריה הקלה של סוללת שיקגו המסחרית העצמאית, שם הוא נלחם בארקנסוס פוסט, פורט גיבסון
צ'מפיון היל, גשר הנהר השחור הגדול, ויקסבורג ומנספילד. במנספילד, החטיבה נלכדה וארנולד נלקח בשבי. הוא היה כלוא במחנה פורד בטקסס במשך 14 חודשים.