בקיץ 1968, קלוקוקה הפכה לסגנית במועצה הלאומית הצ'כית, בית הנמוך הצ'כי בתוך צ'כוסלובקיה במהלך שיא תקופת הרפורמות של אביב פראג. הוא גם הפך לדקן בפקולטה למשפטים בברנו, שם הוא עיצב חוקי בחירות חדשים לצ'כוסלובקיה. עם זאת, באוגוסט 1968 כוחות סובייטיים וחיילי ברית ורשה אחרים פלשו לצ'כוסלובקיה
ושבר את תנועת הליברליזציה. קלוקקה הוסר ממשרדו הציבורי ומשרותיו האקדמיות באוניברסיטה.