כתוב המשך לפרק זה - מסכדוב תמך בהתנגדות מזוינת למה שהוא ראה ככיבוש רוסי של צ'צ'ניה, אך גינה התקפות על אזרחים. הוא כביכול תמך ברצח של הנשיא הצ'צ'ני פרו-רוסי אחמד קדירוב בצ'צ'ניה, תוך גינוי הרצח הרוסי של צ'צ'ני הפרדני לשעבר נשיא Yandarbiyev בקטר בשנת 2004. מסכדוב הכחיש לעיתים קרובות את האחריות לפעולות הטרור האכזריות והגוברות יותר ויותר נגד אזרחים רוסים על ידי חסידיו של באסייב, והוציא ללא הרף גינויים של תקריות כאלה באמצעות דוברים בחו"ל, כגון אחמד זאקייב בלונדון. עם זאת, ב -24 באוקטובר 2002, נתפסו תקשורת רדיו מההודעות של מסכדוב שבה הוא קרא להגברת פעילויות טרור וחבלה בשטח רוסי. ראיות למעורבותו של מסכדוב במשבר בני הערובה בתיאטרון במוסקבה ב-2002 ניתנו על ידי שני הפושעים העיקריים, מובסר ברייב ואבו סעיד. למרות שהוא בתחילה הכחיש אחריות על הפשיטה על נאזראן ב-2004
, שבו 98 שוטרים / חיילים נהרגו, ביולי 2004 Maskhadov הודה בפומבי באחריות להתקפות. באותו חודש, מאסקאדוב הבטיח שתקיפות דומות יתרחשו, ונשבע כי המנצח בבחירות הנשיאותיות הקרובות בצ'צ'ניה יהיה לא לגיטימי ויותקף במידת הצורך. הוא תיאר את המורדים שמאחורי המצור על בית הספר בבסלאן כ"משוגעים" שהשתגעו בגלל מעשי האכזריות של הרוסים וקרא לתקיפת הטרור זוועה.