לאחר חלוקת תת היבשת ההודית, האקדמיה הפקיסטנית למדעים הוקמה בשנת 1953. לאחר שחרור בנגלדש
12 חברים בנגלדיסים (הפקיסטנים המזרחיים אז) של האקדמיה הקימו את אקדמיה למדעים של בנגלדש בשנת 1973. מוחמד קודראט-אי-כודה שימש בתפקיד הנשיא המייסד עד 1976.