כתוב המשך לקטע זה - המשא ומתן לשינוי מוסדות האיחוד האירופי החל בשנת 2001 והביא לראשונה להצעת ההסכם להקמת חוקת אירופה, שהייתה מבטלת את ההסכמים האירופיים הקיימים והחליפה אותם על ידי "חוקת". אף על פי שהאירוע אושר על ידי רוב המדינות החברות, הוא ננטש לאחר שנדחה על ידי 55% מהמצביעים הצרפתים ב-29 במאי 2005 ולאחר מכן על ידי 61% מהמצביעים ההולנדים ב-1 ביוני 2005. לאחר "תקופת התבוננות", מדינות החברות הסכימו במקום זאת לשמור על האמנות הקיימות ולשנות אותן, כדי להפוך לחוק מספר הרפורמות שנקבעו בחוקה הנטושה. אמנת "רפורמה" מתוקנת נכתבה ונחתמה בליסבון בשנת 2007. במקור היה אמור להיות מאושר על ידי כל המדינות החברות עד סוף 2008. לוח הזמנים הזה נכשל, בעיקר בשל הדחייה הראשונית של ההסכם ביוני 2008 על ידי המצביעים האיריים, החלטה שהוחזרה ברפובליקה שנייה
באוקטובר 2009 לאחר אירלנד הבטיחה מספר ויתורים הקשורים לאמנה.