הכוחות היפנים (ה"צי המשולב") למעשה היו מורכבים משני ציים שונים המפורטים בשני מבצעים נפרדים, כלומר מבצע AL
(בשביל האליוטים) ומבצע MI (בשביל מידוויי). הרשימה למטה מראה את כל הספינות שהוקצו למבצע MI, אך רק כוח המכה הראשון של נאגומו וכוח התמיכה של קוריטה היו מעורבים בקרב על מידוויי.