כתוב המשך לפרק זה - פדרו דה פורטוקאררו הגיע למקסיקו זמן קצר לאחר נפילת טנוצ'טיטלן, ולכן לא לקח חלק בכיבוש הספרדי של אימפריה האצטקית. הוא הושם תחת פיקודו של פדרו דה אלברדו והשתתף במערכות הכיבוש באוהאקה, פנוקו (וורקרוז) ובמרכז אמריקה. ביולי 1524, פדרו דה אלברדו מינה את פדרו דה פורטוקאררו כ"רגידור" (יועץ) של ההתנחלות הספרדית החדשה סנטיאגו דה לוס קבלרוס דה גואטמלה, שבאותה עת ממוקמת בעיר איקסימשה של הקאצ'יקל המאיה. זמן קצר לאחר מכן, פורטוקאררו ליווה את אלברדו במסעו לקוזקטלאן (באל סלבדור המודרני). באוגוסט 1526, אלווארדו כינה את פורטוקאררו כאחד משני "אלקאלדים" (שופטים) של גואטמלה. בסוף שנות העשרים של המאה ה-15 הצליח פורטוקאררו לכבות מרד של הקצ'יקלים. זמן קצר לאחר הפלישה הספרדית הראשונה לגואטמלה
ב-1941 העניק אלווארדו לפורטוקאררו את ה"אנקומינדה" הנרחבת של סקטפקיז ואוסטונקלקו, ה"אנקומינדה" הגדולה והיקרה ביותר בגואטמלה, שכללה את כל אזור המאם מאיה הדרומי.