השלים את המשפט הבא: בתחילת מלחמת האזרחים, הייס חזר לשירות כקולונל של גדוד חיל הרגלים המתנדב ה-63 בפנסילבניה, גם מחזיק בדרגת קפטן בחיל הרגלים ה-16 בצבא הרגיל עד היום מ-14 במאי 1861. אנשיו ידעו שהוא "אמיץ כמו אריה". במהלך מסע חצי האי, הוא היה מחובר עם הגדוד שלו לחטיבה הראשונה של הדיוויזיה של קארני של גדוד השלישי של היינטזלמן. הוא נלחם במלחמות של יורקטאון, ויליאמסבורג, שבע אורנים,
תחנת סאבאג', ו"מאלוורן היל". בסיום קרבות שבעת הימים, הוא מונה לסגן קולונל בצבא הרגיל על גבורה בפעולה, שכן הייס כיוון מטען חנית עם הגדוד שלו לתוך קווי האויב כדי לכסות את נסיגת החטיבה שלו. הייס יצא לחופשת מחלה לאחר חודש, סבל מעיוורון חלקי ושיתוק בזרוע שמאל, פציעות שנגרמו בקרב.