השלים את המשפט הבא: בדצמבר 1944, כשהכוחות הפיליפינים והאמריקאים המשותפים המשיכו להתקדם כדי לשחרר את הפיליפינים מכוחות היפנים, ממשלת הרפובליקה הפיליפינית השנייה, שכללה את אקינו, הועברה לבגואיו. לאחר מכן, היא טסה ליפן, שם, יחד עם פקידים אחרים, חבריה נעצרו ונכלאו בכלא סוגאמו
היפנים נכנעו. ב-25 באוגוסט 1946, אקינו נשלח בחזרה לפיליפינים למשפטו באשמת בגידה על ידי בית המשפט העממי; כמה שבועות לאחר מכן הוא שוחרר בערבות.