כמו שאר מזרח פרוסיה, אנגרבורג הושפעה בתחילה רק באופן עקיף ממלחמת העולם השנייה (1939-1945), כגון נפגעי מלחמה ומחסור באספקה. המצב השתנה כשהחזית המזרחית התקרבה בחורף 1944-1945. בניגוד לעיר השכנה גולדאפ שבמזרח, אנגרבורג לא הייתה מעורבת בלחימה, אך הושמדה על ידי הוורמאכט עם התקדמות הצבא האדום הסובייטי. לאחר שהצבא האדום הגיע לאלבינג ונתק את מזרח פרוסיה משאר גרמניה, אזרחי אנגרבורג נאלצו לפנות את המחוז.
על ידי נסיעה מעבר לגינה ויסטלה או לפילאו. הצבא האדום הגיע לאנגרבורג ב-25 בינואר 1945 והרס את רוב העיר; רק כמה בניינים נותרו במרכז העיר הישן.