כתוב המשך לפרק זה - האגודה עוקבת אחר מקורותיה לאגודת הרופאים הפקיסטנית שהוקמה בשנת 1948. לאחר עצמאות בנגלדש
, רופאים בבנגלדש ארגנו מחדש את שרידי האגודה הרפואית הפקיסטנית ואימצו חוקת האגודה הרפואית בבנגלדש ב-14 בינואר 1973.