בפברואר 2005, שר ההגנה שאול מופז החליט לא להאריך את שירותו של יאאלון כמפקד המטה לשנה נוספת. זה סימן את שיא המתחים בין מופז ויאאלון, אשר עלו בחלקו בשל התנגדותו של יאאלון לתוכנית הפרידה מעזה.
אני לא יודע. ב-1 ביוני 2005, יעאלון פרש מהצבא, ודן הלוץ, יורשו כמפקד המטה, פיקח על הפרישה.