השלים את המשפט הבא: גילברט הצטרף לצבא המתנדבים מאוחר יותר מרבים מאנשי ימיו. הוא התגייס באוקטובר 1862. למרות זאת, הוא מונה לקולונל של גדוד חיל הרגלים המתנדב ה-27 של איווה ב-3 באוקטובר 1862. גדודו של גילברט השתתף במלחמה של פרדריק סטיל
משלחת ליטל רוק אבל לא היה מעורב בכל קרבות. הוא הועבר לתפקיד בחיל המצב בארקנסו ולאחר מכן הועבר למיסיסיפי, שם המחלקה שלו הייתה מחוברת לדיוויזיה של אנדרו ג'יי סמית' בקורפוס ה-16 במהלך משלחת מרידיאן.