כדי להוכיח את הלגיטימיות שלו, ז'ו די ביטל את שלטונו של קיסר ג'יאנון והקים מאמץ נרחב להשמיד או לזייף תיעוד הנוגע לילדותו ולמרדתו. זה כלל טיהור מסיבי של המלומדים הקונפוציאניים בנאנקינג והענקת סמכות יוצאת דופן מחוץ לחוק למשטרה החשאית של האפוטרופוסים. אחד המועדפים היה ז'נג ה, אשר השתמש בסמכותו כדי לפתוח במסע חקירה גדול בדרום האוקיינוס השקט והאינדי. הקשיים בנאנקינג הובילו גם את הקיסר יונגלה להקים מחדש את בייפינג (בייג'ינג של ימינו) כבירת האימפריה החדשה. הוא תיקן ופתח מחדש את התעלה הגדולה, ובין 1406 ל-1420, ניהל את בניית העיר האסורה. הוא היה גם אחראי למגדל הפורצלן של נאנקינג, שנחשב לאחד פלאי העולם לפני שהושמד על ידי המורדים הטייפינים.
בשנת 1856. כחלק ממאמציו המתמשכים לשלוט במלומדים-ביורוקרטים הקונפוציאניים, הקיסר יונגל גם הרחיב מאוד את מערכת הבחינות הקיסרית במקום השימוש של אביו בהמלצות וביקורים אישיים. חוקרים אלה השלימו את "אנציקלופדיה יונגל" המונומנטלית בתקופתו.