השלים את המשפט הבא: בשנת 1365<unk>66 ו 1384<unk>85 העיירה שימשה כמקלט עבור בישוף קונסטנץ כאשר הוא גורש מקונסטנץ. לפני 1324 ובין 1371 ל-1376 העיר הועברה לבעלים חיצוניים כביטחון עבור הלוואה. בין השנים 1359 ל-1403 הטירה הייתה בבעלות המקומיים. ב-1374 הם קיבלו פטור ממס המלחמה. השלטון האפיסקופי נחלש על ידי מעבר הריבונות מהבסבורגים למחוז באדן בשנת 1415. בשל מיקומו בגבול הדתי, קייזרסטול הציג ראש גשר חשוב עבור האזורים הקתולים. הן במלחמת וילמרגן הראשונה, בשנת 1655/56, והן במלחמת
במלחמת טוגנבורג (או במלחמת וילמרגן השנייה), בשנת 1712, הכפר היה כבוש על ידי ציריך. במהלך הסכסוכים הדתיים, התנועה לקייזרשטול נאלצה לחצות את הריין באזורים שנשלטו על ידי ציריך. מאחר ולעיר לא הייתה הזכות להטיל מס על תנועת הספינות בנהר הריין, אובדן תנועת הקרקע הזה עלה לעיר ברוב הכנסות המכס שלה. עם זאת, העיירה נשארה משגשגת בשל גידול היין וחוות הבקר, באמצעות האשראי והבנקאות, ובאמצעות שירות חוץ. השגשוג משתקף בבתים האצילים שנבנו בתקופה זו. (Gasthaus zur Krone בשנת 1550, אולם הנהלה של המנזר של סנט בלאז בשנת 1563 ו-1612, ואת "Marschallhaus" בשנת 1764). הבניינים שאיפשרו לקייזרשטול לתפקד כמרכז אזורי היו על הגדה הימנית של הריין, ונעלמו בשנת 1798 עם הקמתה של קנטון באדן. לאחר הרס הגשר על ידי הצרפתים בשנת 1799, תנועת הגבול דרך קייסרסטול נפסקה במשך כמעט שני עשורים.