"פול ג'קובי" בילה את רוב שנת 1943 לא פעיל בארקטיקה לפני שחזר לגרמניה בספטמבר עבור חידוש נוסף. היא נפגעה קשות מהתקפות האוויר של בעלות הברית על קיל ולא הייתה פעילה שוב עד סוף 1944. היא בילה את רוב שאר המלחמה בלוות ספינות כשהגרמנים פינו את פרוסיה המזרחית.
והפצצה על הכוחות הסובייטיים. הספינה נתפסה על ידי בעלות הברית במאי 1945 ובילה את שארית השנה תחת שליטה בריטית כאשר בעלות הברית החליטו כיצד להיפטר מהספינות הגרמניות שנתפסו.