13 בינואר 1986 התחיל מאבק אלים באדן בין תומכיו של עלי נאסר לבין תומכיו של איסמעיל שחזר, שרצה להחזיר את השלטון. קרבות, הידועים כ"מלחמת האזרחים בדרום תימן"
, נמשך יותר מחודש וגרם לאלפי נפגעים, לדיכויו של עלי נאסיר, ולמוותו של איסמעיל. כ -60,000 אנשים, כולל עלי נאסיר הודח, נמלטו ל- YAR. עלי סלים אל-באיד, בן בריתו של איסמעיל שהצליח להימלט מההתקפה על חברי הפוליט-ביורו התומכים באיסמעיל, הפך אז למזכיר הכללי של המפלגה הסוציאליסטית תימנית.