स्ट्रक्चरल जीनोमिक्समध्ये प्रत्येक प्रथिनेची त्रि-आयामी रचना वर्णन करण्याचा प्रयत्न केला जातो. जीनोम आधारित हा दृष्टिकोन प्रायोगिक आणि मॉडेलिंग दृष्टिकोनांच्या संयोजनाद्वारे संरचनेचे निर्धारण करण्यासाठी उच्च-प्रवाह पद्धतीची परवानगी देतो. स्ट्रक्चरल जीनोमिक्स आणि पारंपारिक स्ट्रक्चरल अंदाज यांच्यातील मुख्य फरक असा आहे की स्ट्रक्चरल जीनोमिक्स एका विशिष्ट प्रथिनावर लक्ष केंद्रित करण्याऐवजी जीनोमद्वारे एन्कोड केलेल्या प्रत्येक प्रथिनाची रचना निर्धारित करण्याचा प्रयत्न करते. पूर्ण जीनोम अनुक्रमांच्या उपलब्धतेसह, प्रायोगिक आणि मॉडेलिंग दृष्टिकोनांच्या संयोजनाद्वारे संरचनेचा अंदाज अधिक वेगाने केला जाऊ शकतो, विशेषतः कारण मोठ्या संख्येने अनुक्रमित जीनोम आणि पूर्वीचे निराकरण केलेले प्रथिने संरचना शास्त्रज्ञांना प्रथिने संरचनेचे मॉडेल बनविण्यास अनुमती देतात पूर्वीचे निराकरण केलेले समकक्ष.  प्रथिनेची रचना प्रथिनेच्या कार्याशी जवळून जोडलेली असल्याने, स्ट्रक्चरल जीनोमिक्समध्ये प्रथिनेच्या कार्याबद्दल ज्ञान देण्याची क्षमता आहे. प्रथिने कार्ये स्पष्ट करण्याव्यतिरिक्त, स्ट्रक्चरल जीनोमिक्सचा वापर नवीन प्रथिने गुंडाळणे आणि औषध शोधासाठी संभाव्य लक्ष्य ओळखण्यासाठी केला जाऊ शकतो. स्ट्रक्चरल जीनोमिक्समध्ये संरचना निर्धारित करण्यासाठी मोठ्या संख्येने पध्दतींचा समावेश आहे, ज्यात जीनोमिक अनुक्रम किंवा मॉडेलिंग-आधारित पध्दतींचा वापर करून अनुक्रम किंवा ज्ञात संरचनेच्या प्रथिनांच्या स्ट्रक्चरल होमोलॉजीवर आधारित किंवा रासायनिक आणि भौतिक तत्त्वांवर आधारित आहे. कोणत्याही ज्ञात संरचनेला होमोलॉजी नसलेल्या प्रथिनासाठी.  पारंपारिक स्ट्रक्चरल जीवशास्त्राच्या विरूद्ध, स्ट्रक्चरल जीनोमिक्स प्रयत्नांद्वारे प्रथिने संरचनेचे निर्धारण बहुतेकदा (परंतु नेहमीच नाही) प्रथिने कार्याबद्दल काहीही ज्ञात होण्यापूर्वी येते. यामुळे स्ट्रक्चरल बायोइंफॉर्मेटिक्समध्ये नवीन आव्हाने निर्माण झाली आहेत, म्हणजेच प्रथिनेच्या 3 डी संरचनेतून त्याचे कार्य निश्चित करणे.  स्ट्रक्चरल जीनोमिक्स प्रथिने संरचनांच्या उच्च थ्रूपुट निर्धारावर जोर देते. हे स्ट्रक्चरल जीनोमिक्सच्या समर्पित केंद्रांमध्ये केले जाते.  बहुतेक स्ट्रक्चरल जीवशास्त्रज्ञ वैयक्तिक प्रथिने किंवा प्रथिने गटांच्या संरचनेचा पाठपुरावा करतात, तर स्ट्रक्चरल जीनोमिक्समधील तज्ञ जीनोमच्या विस्तृत प्रमाणात प्रथिनेच्या संरचनेचा पाठपुरावा करतात. याचा अर्थ मोठ्या प्रमाणात क्लोनिंग, अभिव्यक्ती आणि शुद्धीकरण. या दृष्टिकोनाचा एक मुख्य फायदा म्हणजे अर्थव्यवस्थेचा आकार. दुसरीकडे, काही परिणामी रचनांच्या वैज्ञानिक मूल्यावर कधीकधी प्रश्न उपस्थित केला जातो. जानेवारी २००६ मधील एक विज्ञान लेख स्ट्रक्चरल जीनोमिक्स फील्डचे विश्लेषण करतो.  प्रोटीन स्ट्रक्चर इनिशिएटिव्ह सारख्या स्ट्रक्चरल जीनोमिक्सचा एक फायदा असा आहे की वैज्ञानिक समुदायाला नवीन संरचना तसेच क्लोन आणि प्रथिने यासारख्या अभिकर्मकांमध्ये त्वरित प्रवेश मिळतो. एक गैरसोय अशी आहे की यापैकी बर्याच संरचना अज्ञात कार्याच्या प्रथिने आहेत आणि त्यास संबंधित प्रकाशने नाहीत. यासाठी या संरचनात्मक माहितीला व्यापक संशोधन समुदायापर्यंत पोहचवण्याचे नवीन मार्ग आवश्यक आहेत. बायोइन्फॉर्मेटिक्स कोर ऑफ द जॉइंट सेंटर फॉर स्ट्रक्चरल जीनोमिक्स (जेसीएसजी) ने नुकताच एक विकी-आधारित दृष्टिकोन विकसित केला आहे. उच्च-थ्रूपुट स्ट्रक्चरल जीनोमिक्स केंद्रांमधून उदयास येणा protein्या प्रथिनांच्या संरचनेचे वर्णन करण्यासाठी ओपन प्रोटीन स्ट्रक्चर एनोटेशन नेटवर्क (टीओपीएसएएन) आहे.
स्ट्रक्चरल जीनोमिक्स म्हणजे काय?