Vibrio

Vibrio là một chi của vi khuẩn Gram âm, sở hữu một hình dạng cong-que (dấu phẩy), một vài loài trong số đó có thể gây ra ngộ độc thực phẩm, thường kết hợp với ăn hải sản chưa nấu chín. Thường được tìm thấy trong nước muối, các loài Vibrio là loài vi khuẩn kỵ khí thử nghiệm dương tính với chất oxy hóa và không hình thành bào tử. Tất cả các thành viên của chi là cử động dể dàng và có cực roi với lớp vỏ. Các loài Vibrio thường có hai nhiễm sắc thể, điều này không bình thường đối với vi khuẩn. Mỗi nhiễm sắc thể có nguồn gốc sao chép riêng biệt và độc lập, và được bảo tồn cùng nhau theo thời gian trong chi. Các phylogenies gần đây đã được xây dựng dựa trên bộ gen (phân tích trình tự đa điểm). OF Müller (1773, 1786) đã mô tả tám loài thuộc chi Vibrio (bao gồm trong Infusoria), ba trong số đó là dạng xoắn khuẩn. Một số loài khác ngày nay được gán cho eukaryote taxa, ví dụ, Peranema euglenoid hoặc cho tảo Bacillaria. Tuy nhiên, Vibrio Müller, 1773 được coi là tên của một chi động vật học, và tên của chi vi khuẩn đã trở thành Vibrio Pacini, 1854. Filippo Pacini đã phân lập được các vi sinh vật mà ông gọi là "rung động" từ bệnh nhân dịch tả năm 1854, vì khả năng vận động của chúng. Một số loài Vibrio là mầm bệnh. Hầu hết các chủng gây bệnh có liên quan đến viêm dạ dày ruột, nhưng cũng có thể nhiễm trùng vết thương hở và gây nhiễm trùng huyết. Chúng có thể được mang theo bởi nhiều động vật biển, chẳng hạn như cua hoặc tôm, và đã được biết là gây nhiễm trùng gây tử vong ở người trong quá trình tiếp xúc. Nguy cơ mắc bệnh lâm sàng và tử vong tăng với một số yếu tố, chẳng hạn như bệnh tiểu đường không kiểm soát được, nồng độ sắt tăng cao (xơ gan, bệnh hồng cầu hình liềm, bệnh hemochromatosis) và ung thư hoặc các tình trạng suy giảm miễn dịch khác. Các loài Vibrio gây bệnh bao gồm V. cholerae (tác nhân gây bệnh tả), V. parahaemolyticus và V. Vulnificus. V. cholerae thường lây truyền qua nước bị ô nhiễm. Các loài Vibrio gây bệnh có thể gây bệnh từ thực phẩm (nhiễm trùng), thường liên quan đến việc ăn hải sản chưa nấu chín. Các tính năng gây bệnh có thể được liên kết với cảm biến đại biểu, nơi vi khuẩn có thể biểu hiện yếu tố độc lực thông qua các phân tử tín hiệu của chúng. V. Vulnificus bùng phát thường xảy ra ở vùng khí hậu ấm áp và nhỏ, thường gây chết người, dịch thường xuyên xảy ra. Một vụ bùng phát (outbreak) dịch xảy ra ở New Orleans sau cơn bão Katrina, và một số trường hợp gây tử vong xảy ra trong hầu hết các năm ở Florida. Tính đến năm 2013 tại Hoa Kỳ, nhiễm khuẩn Vibrio nói chung đã tăng 43% so với tỷ lệ quan sát được trong năm 20062002008. V. Vulnificus, chủng nặng nhất, không tăng. Nhiễm khuẩn Vibrio từ thực phẩm thường liên quan đến việc ăn động vật có vỏ sống. V. parahaemolyticus cũng liên quan đến hiện tượng Kanagawa, trong đó các chủng phân lập từ vật chủ của người (phân lập lâm sàng) là tán huyết trên đĩa thạch máu, trong khi những chủng phân lập từ nguồn không phải là không tan máu. Nhiều loài Vibrio cũng là động vật. Chúng gây bệnh cho cá và động vật có vỏ, và là nguyên nhân phổ biến gây tử vong trong sinh vật biển trong nước. Chăm sóc y tế phụ thuộc vào sự giới thiệu lâm sàng và sự hiện diện của các điều kiện y tế tiềm ẩn. Bởi vì viêm dạ dày ruột Vibrio tự giới hạn ở hầu hết bệnh nhân, không cần điều trị nội khoa cụ thể. Bệnh nhân không thể dung nạp thay thế nước uống có thể yêu cầu điều trị bằng dung dịch truyền tĩnh mạch. Mặc dù hầu hết các loài vi khuẩn Vibrio rất nhạy cảm với kháng sinh như doxycycline hoặc quinolon, điều trị kháng sinh không rút ngắn quá trình bệnh hoặc thời gian bài tiết mầm bệnh. Tuy nhiên, nếu bệnh nhân bị sốt và sốt cao hoặc có tình trạng bệnh lý tiềm ẩn, có thể bắt đầu điều trị bằng kháng sinh đường uống với doxycycline hoặc quinolone. Bệnh nhân bị nhiễm trùng không nhiễm trùng Vibrio hoặc nhiễm trùng huyết nặng hơn nhiều và thường có các điều kiện y tế khác. Điều trị nội khoa bao gồm: Bắt đầu điều trị bằng kháng sinh hiệu quả (doxycycline hoặc quinolone) Điều trị nội khoa tích cực với thay thế chất lỏng và thuốc vận mạch tích cực để hạ huyết áp và sốc nhiễm trùng để điều chỉnh các bất thường về axit-base và điện giải có thể liên quan đến nhiễm trùng huyết nặng Cắt bỏ mê sảng sớm trong vòng 24 giờ sau khi phát triển các triệu chứng lâm sàng có thể cứu sống được ở những bệnh nhân bị viêm cân hoại tử. Bóc tách sớm vết thương bị nhiễm trùng có vai trò quan trọng trong trị liệu thành công và đặc biệt được chỉ định để tránh cắt cụt ngón tay, ngón chân hoặc tay chân. Đánh giá và can thiệp phẫu thuật khẩn cấp và nối tiếp là cần thiết vì bệnh nhân có thể xấu đi nhanh chóng, đặc biệt là những người bị viêm cân hoại tử hoặc hội chứng khoang. Phẫu thuật tái tạo, chẳng hạn như ghép da, được sử dụng trong giai đoạn phục hồi. V. harveyi là mầm bệnh của một số động vật thủy sinh và đáng chú ý là nguyên nhân gây ra chứng rung cảm phát sáng ở tôm (tôm). Các loài Vibrio "điển hình", được phát hiện sớm, chẳng hạn như V. cholerae, có một tiên mao đơn cực (đơn bào) có vỏ bọc. Một số loài, chẳng hạn như V. parahaemolyticus và V. alginolyticus, có cả một lá cờ đơn cực với vỏ bọc và lá cờ mỏng chiếu theo mọi hướng (peritrichous), và các loài khác, như V. fischeri, có búi của cột cờ cực (lophotrichous). Biến đổi tự nhiên là một sự thích nghi phổ biến của vi khuẩn đối với việc chuyển DNA sử dụng nhiều sản phẩm gen của vi khuẩn. Để một vi khuẩn người nhận liên kết, tiếp nhận và tái tổ hợp DNA ngoại sinh vào nhiễm sắc thể của nó, nó phải trở nên đủ năng lực (competent), nghĩa là vào trạng thái sinh lý đặc biệt. Quá trình hấp thu DNA của V. cholerae có khả năng tự nhiên bao gồm một pilus do năng lực mở rộng và một protein gắn DNA hoạt động như một con rachet và cuộn DNA vào trong periplasm. Biến đổi tự nhiên cũng đã được mô tả cho V. fishingi, V. Vulnificus và V. parahaemolyticus. V. cholerae đã được sử dụng trong các khám phá về nhiều RNA nhỏ của vi khuẩn. Sử dụng sRNA-Seq và ứng viên sRNA ứng cử viên phía Bắc đã được xác định và đặc trưng là IGR-sRNA (vùng intragenic), AS-sRNA (được phiên mã từ chuỗi antisense của [[khung đọc mở (ORF) và có nguồn gốc ORF. Một trong những ứng cử viên từ nghiên cứu này, IGR7, đã được chứng minh có liên quan đến chuyển hóa carbon và sau đó đổi tên thành MtlS RNA. Các sRNA khác được xác định trong V. cholerae thông qua sàng lọc di truyền và phương pháp tính toán bao gồm RNA Qrr, RNA điều hòa Vibrio của OmpA, MicX sRNA, Vibrio cholerae ToxT RNA hoạt hóa, RNA tfoR và VqmR sRNA. Độc tố tả ^ Thompson FL, Gevers D, Thompson CC, Dawyndt P, Naser S, Hoste B, Munn CB, Swings J (2005). “Phylogeny and Molecular Identification of Vibrios on the Basis of Multilocus Sequence Analysis”. Applied and Environmental Microbiology. 71 (9): 5107–5115. doi:10.1128/AEM.71.9.5107-5115.2005. PMC 1214639. PMID 16151093. ^ Ryan KJ; Ray CG biên tập (2004). Sherris Medical Microbiology (ấn bản 4). McGraw Hill. ISBN 978-0-8385-8529-0. ^ a b Faruque SM; Nair GB biên tập (2008). Vibrio cholerae: Genomics and Molecular Biology. Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-33-2. ^ Madigan, Michael; Martinko, John biên tập (2005). Brock Biology of Microorganisms (ấn bản 11). Prentice Hall. ISBN 978-0-13-144329-7. ^ Trucksis, Michele; Michalski, Jane; Deng, Ying Kang; Kaper, James B. (ngày 24 tháng 11 năm 1998). “The Vibrio cholerae genome contains two unique circular chromosomes”. Proceedings of the National Academy of Sciences (bằng tiếng Anh). 95 (24): 14464–14469. doi:10.1073/pnas.95.24.14464. ISSN 0027-8424. PMC 24396. PMID 9826723. ^ Okada, Kazuhisa; Iida, Tetsuya; Kita-Tsukamoto, Kumiko; Honda, Takeshi (ngày 15 tháng 1 năm 2005). “Vibrios Commonly Possess Two Chromosomes”. Journal of Bacteriology (bằng tiếng Anh). 187 (2): 752–757. doi:10.1128/JB.187.2.752-757.2005. ISSN 0021-9193. PMC 543535. PMID 15629946. ^ Rasmussen, Tue; Jensen, Rasmus Bugge; Skovgaard, Ole (ngày 11 tháng 7 năm 2007). “The two chromosomes of Vibrio cholerae are initiated at different time points in the cell cycle”. The EMBO Journal (bằng tiếng Anh). 26 (13): 3124–3131. doi:10.1038/sj.emboj.7601747. ISSN 0261-4189. PMC 1914095. PMID 17557077. ^ Kirkup, Benjamin C.; Chang, LeeAnn; Chang, Sarah; Gevers, Dirk; Polz, Martin F. (ngày 1 tháng 1 năm 2010). “Vibrio chromosomes share common history”. BMC Microbiology. 10: 137. doi:10.1186/1471-2180-10-137. ISSN 1471-2180. PMC 2875227. PMID 20459749. ^ Pot, B., Gillis, M., and De Ley, J., The genus Aquaspirillum. In: Balows, A., Trüper, H.G., Dworkin, M., Harder, W., Schleifer, K.-H. (Eds.). The prokaryotes, 2nd ed, vol. 3. Springer-Verlag. New York. 1991 ^ Hugh, R. (1964). The proposed conservation of the generic name Vibrio Pacini 1854 and designation of the neotype strain of Vibrio cholerae Pacini 1854. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 14(2), 87-101,[liên kết hỏng]. ^ http://www.whonamedit.com/doctor.cfm/2605.html ^ Lee, Michelle T.; Dinh, An Q.; Nguyen, Stephanie; Krucke, Gus; Tran, Truc T. (ngày 28 tháng 3 năm 2019). “Late-onset Vibrio vulnificus septicemia without cirrhosis”. Baylor University Medical Center Proceedings. 0 (0): 1–3. doi:10.1080/08998280.2019.1580661. ISSN 0899-8280. PMC 6541083. ^ Tan, Wen-Si; Muhamad Yunos, Nina Yusrina; Tan, Pui-Wan; Mohamad, Nur Izzati; Adrian, Tan-Guan-Sheng; Yin, Wai-Fong; Chan, Kok-Gan (ngày 8 tháng 7 năm 2014). “Characterisation of a Marine Bacterium Vibrio Brasiliensis T33 Producing N-acyl Homoserine Lactone Quorum Sensing Molecules”. Sensors. 14 (7): 12104–12113. doi:10.3390/s140712104. PMC 4168498. PMID 25006994. ^ Jablecki J, Norton SA, Keller GR, DeGraw C, Ratard R, Straif-Bourgeois S, Holcombe JM, Quilter S, Byers P, McNeill M, Schlossberg D, Dohony DP, Neville J, Carlo J, Buhner D, Smith BR, Wallace C, Jernigan D, Sobel J, Reynolds M, Moore M, Kuehnert M, Mott J, Jamieson D, Burns-Grant G, Misselbeck T, Cruise PE, LoBue P, Holtz T, Haddad M, Clark TA, Cohen A, Sunenshine R, Jhung M, Vranken P, Lewis FM, Carpenter LR (2005). “Infectious Disease and Dermatologic Conditions in Evacuees and Rescue Workers After Hurricane Katrina - Multiple States, August–September, 2005”. Mortality and Morbidity Weekly Report. 54: 1–4. ^ Bureau of Community Environmental Health, Division of Environmental Health, Florida Department of Health (2005). “Annual Report, Florida”. Food and Waterborne Illness Surveillance and Investigation: 21.Quản lý CS1: nhiều tên: danh sách tác giả (liên kết) ^ “Infections from some foodborne germs increased, while others remained unchanged in 2012”. Centers for Disease Control. ngày 18 tháng 4 năm 2013. Truy cập ngày 19 tháng 4 năm 2013. ^ Joseph S, Colwell R, Kaper J (1982). “Vibrio parahaemolyticus and related halophilic Vibrios”. Crit Rev Microbiol. 10 (1): 77–124. doi:10.3109/10408418209113506. PMID 6756788. ^ Austin B, Zhang XH (2006). “Vibrio harveyi: a significant pathogen of marine vertebrates and invertebrates”. Letters in Applied Microbiology. 43 (2): 119–214. doi:10.1111/j.1472-765X.2006.01989.x. PMID 16869892. ^ George M. Garrity biên tập (2005). Bergey's manual of Systematic Bacteriology. Vol. 2 Part B (ấn bản 2). Springer. tr. 496–8. ISBN 978-0-387-24144-9. ^ Chen I, Dubnau D (2004). “DNA uptake during bacterial transformation”. Nat. Rev. Microbiol. 2 (3): 241–9. doi:10.1038/nrmicro844. PMID 15083159. ^ Bernstein H, Bernstein C, Michod RE (2018). Sex in microbial pathogens. Infection, Genetics and Evolution volume 57, pages 8-25. https://doi.org/10.1016/j.meegid.2017.10.024 ^ Matthey N, Blokesch M (2016). “The DNA-Uptake Process of Naturally Competent Vibrio cholerae”. Trends Microbiol. 24 (2): 98–110. doi:10.1016/j.tim.2015.10.008. PMID 26614677. ^ Pollack-Berti A, Wollenberg MS, Ruby EG (2010). “Natural transformation of Vibrio fischeri requires tfoX and tfoY”. Environ. Microbiol. 12 (8): 2302–11. doi:10.1111/j.1462-2920.2010.02250.x. PMC 3034104. PMID 21966921. ^ Gulig PA, Tucker MS, Thiaville PC, Joseph JL, Brown RN (2009). “USER friendly cloning coupled with chitin-based natural transformation enables rapid mutagenesis of Vibrio vulnificus”. Appl. Environ. Microbiol. 75 (15): 4936–49. doi:10.1128/AEM.02564-08. PMC 2725515. PMID 19502446. ^ Chen Y, Dai J, Morris JG, Johnson JA (2010). “Genetic analysis of the capsule polysaccharide (K antigen) and exopolysaccharide genes in pandemic Vibrio parahaemolyticus O3:K6”. BMC Microbiol. 10: 274. doi:10.1186/1471-2180-10-274. PMC 2987987. PMID 21044320. ^ Liu, Jane M.; Livny, Jonathan; Lawrence, Michael S.; Kimball, Marc D.; Waldor, Matthew K.; Camilli, Andrew (tháng 4 năm 2009). “Experimental discovery of sRNAs in Vibrio cholerae by direct cloning, 5S/tRNA depletion and parallel sequencing”. Nucleic Acids Research. 37 (6): e46. doi:10.1093/nar/gkp080. ISSN 1362-4962. PMC 2665243. PMID 19223322. Bộ gen Vibrio và thông tin liên quan tại PATRIC, Trung tâm tài nguyên tin sinh học được tài trợ bởi NIAID Hướng dẫn phân tích vi khuẩn trực tuyến