في يوم عيد الميلاد، 25 ديسمبر 1642 (NS 4 يناير 1643) "ساعة أو ساعتين بعد منتصف الليل"، في وولستورب مانور في وولستورب باي كولسترورث، قرية صغيرة في مقاطعة لينكولنشاير. والده، المسمى إيزاك نيوتن، مات قبل ثلاثة أشهر. ولد قبل الأوان، نيوتن كان طفل صغير؛ أمه هانا آيسكوف ذكرت أنه كان يمكن أن يصلح داخل كوب رباعي. لما كان نيوتن عمره ثلاثة، تزوجت أمه مرة أخرى وذهبت للعيش مع زوجها الجديد، القس بارناباس سميث، تاركة ابنها في رعاية أمه الأم، مارجري آيسكوف.
جدته من جهة أمها، مارجري آيسكو