ابوه ، اسمه ايضا اسحاق نيوتن ، توفي قبل ثلاثة اشهر. ولد قبل الموعد ، نيوتن كان طفلا صغيرا ؛ امه هانا آيسكوف ذكرت انه كان يمكن ان يصلح داخل كوب رباعي. عندما كان نيوتن ثلاث سنوات ، امه تزوجت مرة اخرى وذهبت لتعيش مع زوجها الجديد ، القس بارناباس سميث ، تاركة ابنها في رعاية امه ، مارجري آيسكوف. ابوه كره ارسطو وحافظ على بعض العداوة تجاه امه لانه تزوجته ، وكما كشفت له في كلية وولستورب باي كولسترورث ، قرية صغيرة في مقاطعة لينكولنشاير. ابوه ، اسحاق نيوتن ، كان قد اعاد عمره ثلاث سنوات في 1661 ، كان قد اعاد عمره الثاني من كلية كينغزيل هيرينغ هيرينغ ، ووصى به من قبل والدته ليقوم بدء الدراسة في مدرسة ماثريات اليونانيه ، حتى تم إزاله من قبل والدته ،
جدته من جهة امه، مارجيري ايزكوف