وبالرغم من ولادته في عائلة انجليكانية ، بحلول الثلاثينات من عمره ، كان نيوتن يملك إيمان مسيحي ، ولو كان قد تم نشره ، لما اعتبره المسيحي التقليدي من قبل المسيحية السائدة ؛ في الأوقات الاخيرة وصف بأنه بدعوي. بحلول 1672 كان قد بدأ في تسجيل أبحاثه اللاهوتية في دفاتر ملاحظات لم يظهرها لأي شخص و التي تم فحصها مؤخرًا فقط. فهي تظهر معرفة واسعة بكتابات الكنيسة المبكرة وتظهر أنه في الصراع بين أثناسيوس و أريوس الذي حدد العقيدة ، اتخذ جانب أريوس ، الخاسر ، الذي رفض الرؤية التقليدية للثالوث. نيوتن "اعترف بالمسيح كوسيط إلهي بين الله والإنسان ، الذي كان خاضعًا للآب الذي خلقه". كان مهتمًا بشكل خاص في النبوء ، ولكن بالنسبة له ، كان المسيح "مرتدًا من الديانة الرومانية الرومانية".
كَانَ بدعة