وُلِد قبل الموعد، كان نيوتن طفلا صغيرا; وذكرت أمه هانا آيسكوفي بعد ذلك أنه كان يمكن أن يصلح داخل كوب رباعي. وعندما كان نيوتن في الثالثة من عمره، تزوجت أمه من جديد وذهبت للعيش مع زوجها الجديد، القس بارناباس سميث، تاركة ابنها في رعاية أمه الأم، مارجري آيسكوفي. أبوه أرسطو كره أرسطو ويحتفظ ببعض العداوة تجاه أمه الزوجة له، كشف عن ذلك في كلية وولستورب باي كولسترورث، قرية صغيرة في مقاطعة لينكولنشاير. في شهر أكتوبر عام 1661، عندما كان عمره حوالي ثلاث سنوات، أوصاه أمه أن يعود إلى كلية هيرموند غرانت هيرموند غرانت، التي كانت قد أعلنت له أن يدرس مع أمه لغة اليونانية، حتى تم إزاله في المدرسة الثانية، حيث أنه كان قد عاد إلى كلية هيرموند غرانت،
جده من جهة امه، مارجري آيسكوف