أكمل هذه الجملة: في 18 سبتمبر 2020، سجل مولر هدفه الأول هذا الموسم وصنع آخر في الفوز 8–0 على شالكه. تمكن لاحقًا من الفوز
بكأس السوبر الأوروبي وكأس السوبر الألماني ليكون لقبه السابع والعشرين في مسيرته الكروية؛ ليصبح اللاعب الأكثر تتويجًا في تاريخ ألمانيا، محطمًا الرقم القياسي السابق البالغ 26 لقب التي فاز بها زميله السابق في بايرن ميونيخ باستيان شفاينشتايغر. في 11 فبراير 2021، ثبتت إصابته بمرض فيروس كورونا 2019 ودخل الحجر الصحي؛ وبالتالي، لا يمكن اللعب في نهائي كأس العالم للأندية 2020.